1、cpa联盟的价值没有得到充分的体现
目前国内cpa联盟广告的价值还没有得到充分的认可，联盟广告中的品牌广告主仍然很少，各联盟平台的广告主资源重叠率较高，广告主仍然需要挖掘。
此外，联盟成员在产业链中仍处于从属地位，议价能力差。随着网络广告的发展，越来越多的品牌广告主逐渐增加网络广告的投放成本。
相比门户网站，cpa联盟广告的广告价值并没有得到大多数品牌广告主的认可。部分品牌广告主只是在初期阶段尝试推出，大部分品牌广告主对投放过程和效果持观望态度。
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2、流量资源高度重合
大部分广告联盟基本相当于站长联盟，联盟群体流量资源的重叠度高。
站长逐利和低水平的联盟平台竞争，使目前国内cpa广告联盟陷入价格竞争的低水平竞争阶段。
一方面，广告联盟对有影响力的网站吸引力较小，优质流量不多，导致对广告主的吸引力不足；
另一方面，目前中小网站的主要收入来源是网络广告联盟带来的广告收入。所以这些网站为了获得更高的收益，往往会加入多个网站联盟，对单个联盟平台的忠诚度并不高。
基于以上原因，很容易导致联盟平台为了聚集优秀的站点资源而陷入价格竞争的怪圈，而不是专注于品牌和服务。
3、联盟平台不规范问题严重
目前很多的刷量、作弊等不规范问题危及了网络广告联盟产业链的发展。
由于广告联盟各方关注的利益不同，计费支付方式的起点也不同。很多中小型网站为了追求短期利益，往往采用非标准的方式来提高广告效果，即刷假量、点击作弊，而不是基于广告本身来产生新用户或增加活跃用户。
因此，通常在线广告停止后，广告主会发现广告追踪数据显著下降，这也影响了很多广告主投放联盟广告的积极性。
